این جی ایس کے درمیان فرق اور منظوری کا خطرہ

Anonim

کلیدی فرق - این جی ایس بمقابلہ سنجیدگی سے بچاؤ

اگلے نسل کی ترتیب (این جی ایس) اور سیجننگ کو سنبھالنے میں دو قسم کے نیوکللیڈائڈ ترتیب وقت کی تیاری کر رہے ہیں. سنجیدگی کا طریقہ کار کئی سال تک بڑے پیمانے پر استعمال کیا گیا تھا اور این جی ایس اس حال میں اس کے فوائد کی وجہ سے بدل گیا تھا. این جی ایس اور سنجیدگی کی ترتیب کے درمیان اہم فرق یہ ہے کہ این جی ایس ایک اصول نظام کے ذریعہ تیز رفتار طریقے سے لاکھوں ترتیبات کی ترتیب کے اصول پر کام کرتی ہے جبکہ ڈینکسیکسینکولوڈائڈس کے انتخابی ادارے کی وجہ سے سنجیدگی کے سلسلے کے پرنسپل پر کام کرتا ہے. ڈی این اے کی نقل و حرکت کے دوران ڈی این اے پولیمرس انزائم اور کیپلیری الیکٹروفورسس کے نتیجے میں اختلاط علیحدہ علیحدگی.

فہرست

1. جائزہ اور کلیدی فرق

2. نکلیوٹائڈ کی ترتیب

3 کیا ہے. این جی ایس

4 کیا ہے. سنجیدگی سے متعلق کیا چیز ہے

5. سائڈ موازنہ کی جانب سے سائیڈ - این جی ایس بمقابلہ سنجیدگی سے متعلق

6. خلاصہ

نکلیوٹائڈ کی منظوری کیا ہے؟

جینیاتی معلومات آرگنائزیشن کے ڈی این اے یا آر این اے کے نیوکللیڈائڈ کے ترتیب میں محفوظ کیا جاتا ہے. ایک ٹکڑے ٹکڑے (ایک جین، کلسٹرز، اور مکمل جینوم میں) نکلیوٹائڈز (چار اڈوں کا استعمال کرتے ہوئے) کے درست حکم کا تعین کرنے کے عمل کو نیوکللیڈس ترتیب کے طور پر جانا جاتا ہے . جینومک مطالعہ، فارنک مطالعہ، حیاتیات، حیاتیاتی نظام، طبی تشخیص، بایو ٹکنالوجی اور جینوں کی ساخت اور فنکشن کا تجزیہ کرنے میں یہ بہت ضروری ہے. سائنسدانوں کی طرف سے تیار کی ترتیب کے طریقوں کی مختلف اقسام ہیں. ان میں سے، سالگرہ کی ترتیب میں 1977 میں فریڈرک سنجر کی طرف سے تیار کردہ وسیع پیمانے پر استعمال کیا جاتا تھا اور اسے طویل عرصہ تک اگلے نسل کی منظوری کے بعد تبدیل کر دیا گیا تھا.

این جی ایس کیا ہے؟

اگلے نسل کی منظوری (این جی ایس) ایک جدید اصطلاح ہے جس میں جدید اعلی throughput ترتیب عمل کا حوالہ دیا جاتا ہے. یہ مختلف جدید ترتیب کی تکنیکوں کی وضاحت کرتا ہے جس نے جینومک مطالعہ اور آلوکولر حیاتیات میں انقلاب کیا. ان تکنیکز الومومینا آرڈرنگ ہیں، روشی 454 ترتیب، آئن پروٹون آرڈرنگ اور SOLID (ترتیب سے اوگالو لیزیشن پتہ) کی ترتیب. این جی ایس نظام تیز اور سستی ہیں. این جی ایس کے نظام میں چار اہم ڈی این اے ترتیب کے طریقوں کا استعمال کیا جاتا ہے؛ پیروی کے بعد، سنجیدگی کی طرف سے ترتیب، ligation اور آئن سیمکولیڈالک ترتیب کی طرف سے ترتیب. ڈی این اے یا آر این اے کی ایک بڑی تعداد (لاکھوں) متوازی طور پر ترتیب کیا جا سکتا ہے. یہ ایک مختصر وقت کے عرصے کے دوران حیاتیات کے پورے جینوم کی ترتیب کی اجازت دیتا ہے، جس کے نتیجے میں سنجر کی ترتیب میں زیادہ وقت لگتا ہے.

این جی ایس روایتی ترتیب سنجیدہ طریقہ پر بہت سے فوائد ہیں. یہ ایک تیز رفتار، زیادہ درست اور سرمایہ کاری مؤثر عمل ہے جس کا ایک چھوٹا نمونہ سائز کے ساتھ کیا جا سکتا ہے. این جی ایس کا استعمال میٹینگنومک مطالعہ میں استعمال کیا جا سکتا ہے، انفرادی جینوم کے اندر اندر انضمام اور ختم ہونے کی وجہ سے اور جین اظہار کے تجزیہ میں.

Figure_1: اینجی ایس ایس کی تصحیح میں ترقیات

سیجننگ سے متعلق کیا بات ہے؟

سیجننگ کو سنبھالنے کا ایک ترتیب طریقہ ہے جس میں فرییرک سنجر اور ان کے ساتھیوں نے 1977 میں دیئے گئے ڈی این اے ٹکڑے ٹکڑے کے عین مطابق نیوکللیٹائڈ آرڈر کا تعین کرنے کے لئے تیار کیا. یہ چین ختم ہونے والی ترتیب یا ڈویڈسی ترتیب کے طور پر بھی جانا جاتا ہے. اس طریقہ کار کے کام کرنے والے اصول ڈی وی اے کی نقل و حرکت کے دوران ڈی وی جی ٹی، ڈی ڈی سی ٹی پی، ڈی ڈی ٹی پی، ڈی ڈی اے ٹی پی اور ڈی ڈی ٹی پی کے ذریعے ڈی این اے پولیمریس کے ذریعہ ڈی وی ویکسائیولولوڈس (ddNTPs) کو ختم کرنے کی ایک چینل کے انتخابی شامل کی طرف سے بھوک لگی ہے. معمولی نیوکلیوٹڈس 3 'OH گروہوں کے قریب قریب نکلیوٹائڈز کے درمیان فاسفڈیسٹرسٹر بانڈ کے قیام کے لئے بھوک بنانے کی تشکیل جاری رکھیں. تاہم، ڈی ڈی این ٹی اس 3 'OH گروپ کی کمی نہیں ہیں اور نیوکللیڈائڈز کے درمیان فاسفڈیسٹرسٹر بانڈز بنانے میں ناکام ہیں. لہذا، سلسلہ کی تنازعہ ختم ہوگئی ہے.

اس طریقہ میں، ایک ہی بگاڑنے والے ڈی این اے کو ترتیب دیا جائے گا وٹرو ڈی این اے کی ترکیب کے لئے ٹیمپلیٹ ہینڈل کے طور پر کام کرتا ہے. دیگر ضروریات oligonucleotide پریمر، deoxynucleotide قدیم اور ڈی این اے پالیمرس انزمی ہیں. جب ہدف ٹکڑا کے فلاپنگ ختم ہوجاتا ہے، تو پریمر آسانی سے ڈی این اے کی نقل کے لئے ڈیزائن کیا جا سکتا ہے. چار علیحدہ ٹیوبوں میں چار علیحدہ ڈی این اے کے تجزیہ ردعمل کئے جاتے ہیں. ہر ٹیوب میں دوسری ضروریات کے ساتھ الگ الگ ڈی ڈی این ٹی ہے. خاص طور پر نیوکللیٹائڈ سے، ڈی این ٹی پی اور ڈی ڈی این ٹی کے ایک مرکب شامل ہیں. اسی طرح، چار الگ الگ رد عمل چار مرکبوں میں چار مرکب کے ساتھ کئے جاتے ہیں. ردعمل کے بعد، ٹکڑا پیٹرن کے ڈی این اے ٹکڑے ٹکڑے اور تبادلوں کا پتہ لگانے کے بارے میں معلومات کو انجام دیا جاتا ہے. نتیجے میں ڈی این اے ٹکڑے ٹکڑے گرمی منفی اور جیل الیکٹروفورسس کی طرف سے الگ کر رہے ہیں. اگر تابکاری نیوکلیوٹائڈز استعمال کیے جاتے ہیں تو، polyacrylamide جیل میں بینڈنگ پیٹرن autoradiography کی طرف سے تصور کیا جا سکتا ہے. جب یہ طریقہ fluorescently ٹیگ کردہ ڈیوڈیکسینیوولولوڈس استعمال کرتا ہے تو، جیل کو کم کرنے اور فلوریسنٹ ڈٹریکٹر کی طرف سے پتہ چلا جاسکتا ہے کہ لیزر کی بیم کے ذریعہ گزر جاتا ہے. آنکھوں کی طرف سے ایک ترتیب پڑھ جب غلطی سے بچنے کے لئے اور کمپیوٹر میں دستی طور پر داخل کرنے کے لئے، یہ طریقہ کمپیوٹر کے ساتھ مل کر خود کار طریقے سے sequencer کے استعمال میں تیار کیا.

یہ انسانی جینوموم منصوبے سے ڈی این اے ترتیب کے لئے استعمال کیا طریقہ ہے. یہ طریقہ کار اب بھی اعلی درجے کی ترمیم کے ساتھ استعمال میں ہے کیونکہ مہنگی اور سست عمل ہونے کے باوجود یہ درست ترتیب کی معلومات فراہم کرتا ہے.

Figure_2: سنجیدگی سے بچاؤ

این جی جی اور سیجننگ کے درمیان فرق کیا فرق ہے؟

- مختلف آرٹیکل مڈل ٹیبل سے پہلے ->

این جی ایس بمقابلہ سنجیدگی سے متعلق

اگلے نسل کی منظوری (این جی ایس) جدید اعلی throughput ترتیب عمل کا حوالہ دیتے ہیں.یہ کئی جدید ترتیب کی تکنیکوں کی وضاحت کرتا ہے سیجننگ کو سنبھالنے میں ایک ڈی آر اے ٹکڑے ٹکڑے کی درست نکلیوٹائڈ آرڈر کا تعین کرنے کے لئے فریڈرک سنجر کی طرف سے تیار ایک ترتیب طریقہ ہے.
لاگت اثر اندازی
این جی ایس سستی عمل ہے کیونکہ اس وقت، انسان کی طاقت اور کیمیکل کم ہوجاتی ہے. یہ ایک مہنگی عمل ہے کیونکہ اس وقت، انسان کی طاقت اور زیادہ کیمیکل لیتا ہے.
سپیڈ
یہ جلد ہی تیز ہے کیونکہ دونوں کیمیائی پتہ لگانے اور بہت سارے کناروں کی سگنل کا پتہ لگانے متوازی ہو رہا ہے. یہ وقت لگ رہا ہے کیونکہ کیمیائی پتہ لگانے اور سگنل کا پتہ لگانے دو الگ الگ عملوں کے طور پر ہوتا ہے اور صرف ایک وقت میں بھوک لگی ہے.
مطابقت
این جی ایس قابل اعتماد ہے. خطرے کی ترتیب میں کم قابل اعتماد ہے
نمونہ سائز
این جی ایس ڈی این اے کی کم مقدار کی ضرورت ہوتی ہے. اس طریقہ کار کی ایک بڑی تعداد ڈیجیٹل ڈی جی اے کی ضرورت ہے.
متوقع انگور کے مطابق ڈی این اے اراکین
ترتیب کے ٹکڑے پر ڈی این اے اڈوں کی تعداد سنجر طریقہ سے کم ہے پیدا ہونے والے ترتیبات این جی ایس کی ترتیبوں سے زیادہ لمبائی ہیں.

خلاصہ - این جی ایس بمقابلہ سینجر سیشن

این جی ایس اور سنجیدگی سے بچنے کے سلسلے میں بڑے پیمانے پر آلوکولر حیاتیات میں بڑے پیمانے پر استعمال کیا جاتا نیوکللیڈڈ ترتیب کی تکنیک ہیں. سنجیدہ ترتیب ایک ابتدائی ترتیب کا طریقہ ہے جو این جی ایس کی طرف سے تبدیل کیا گیا تھا. این جی ایس اور سنجیدگیشن کے درمیان اہم فرق یہ ہے کہ این جی ایس سنجر آرڈرنگ کے مقابلے میں تیز رفتار، زیادہ درست اور سرمایہ کاری مؤثر عمل ہے. دونوں تکنیکوں نے جینیاتی اور بایو ٹیکنیکل سائنس میں بڑے مادہ پیدا کیے.

حوالہ:

1. ابروسین، منو. "Eukaryotic مائیکروجنزم کے لئے اگلے نسل کے حصول کی تکنیک: حیاتیاتی مسائل کے حل کی بنیاد پر حل. "یوروٹریٹ سیل. مائیکرو بولوجیولوجی کے لئے امریکی سوسائٹی، ستمبر 2010. ویب. 18 فروری 2017

2. سنجر، ایف. ایس ایسنسن، اور اے آر. کولسن. "چین ختم ہونے والی روک تھام کے ساتھ ڈی این اے کی ترتیب. "نیشنل اکیڈمی آف سائنسز کے عملے 74. 12 (1977): 5463-467. ویب.

3. لیو، لن، Yinhu لی، Siliang لی، نی ہو، Yimin وہ، رے پونگ، ڈینی لن، Lihua لو، اور Maggie قانون. "اگلے نسل کی منظوری کے نظام کے مقابلے میں. "جرنل آف بومومیڈینن اور بائیو ٹیکنالوجی 2012 (2012): 1-11. ویب.

تصویری عدلیہ:

"خطرے کی ترتیب" کی طرف سے ایسٹیوزج - اپنے کام (CC BY-SA 3. 0) کی طرف سے ویکیپیڈیا کے ذریعہ

"اگلے نسل کی ترتیب میں ترقیات" نیدربرگٹ، لیکس (2012) - (CC BY 3. 0) دوم ویکیپیڈیا کے ذریعے